Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3W2

0610009B22Rik, MCG6979, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
0610009B22RikQ8R3W2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
0610009B22RikQ8R3W2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms