Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClmpQ8R373 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClmpQ8R373 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClmpQ8R373 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClmpQ8R373 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClmpQ8R373 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClmpQ8R373 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClmpQ8R373 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClmpQ8R373 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClmpQ8R373 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClmpQ8R373 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClmpQ8R373 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClmpQ8R373 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClmpQ8R373 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClmpQ8R373 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClmpQ8R373 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClmpQ8R373 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClmpQ8R373 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClmpQ8R373 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClmpQ8R373 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ClmpQ8R373 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms