Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc12Q8R344 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms