Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2E6

V1ra11, Vomeronasal type-1 receptor A11, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1ra11Q8R2E6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms