Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms