Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0F3

Sumf1, Sulfatase-modifying factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumf1Q8R0F3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms