Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Z9

Pom121, Nuclear envelope pore membrane protein POM 121, mousemouse

Predictions only

Length 1,200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pom121Q8K3Z9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Pom121Q8K3Z9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pom121Q8K3Z9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
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Pom121Q8K3Z9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Pom121Q8K3Z9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Pom121Q8K3Z9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pom121Q8K3Z9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pom121Q8K3Z9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pom121Q8K3Z9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pom121Q8K3Z9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pom121Q8K3Z9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pom121Q8K3Z9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pom121Q8K3Z9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pom121Q8K3Z9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Pom121Q8K3Z9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Pom121Q8K3Z9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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