Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Vrk3Q8K3G5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Vrk3Q8K3G5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Vrk3Q8K3G5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Vrk3Q8K3G5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Vrk3Q8K3G5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Vrk3Q8K3G5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Vrk3Q8K3G5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Vrk3Q8K3G5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Vrk3Q8K3G5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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