Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Lrrtm1Q8K377 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Lrrtm1Q8K377 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Lrrtm1Q8K377 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Lrrtm1Q8K377 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Lrrtm1Q8K377 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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Lrrtm1Q8K377 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Lrrtm1Q8K377 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Lrrtm1Q8K377 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Lrrtm1Q8K377 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Lrrtm1Q8K377 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Lrrtm1Q8K377 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Lrrtm1Q8K377 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Lrrtm1Q8K377 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Lrrtm1Q8K377 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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