Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Stn1Q8K2X3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms