Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Paf1Q8K2T8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Paf1Q8K2T8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms