Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q5

Chchd7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd7Q8K2Q5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Chchd7Q8K2Q5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Chchd7Q8K2Q5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Chchd7Q8K2Q5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chchd7Q8K2Q5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms