Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scara5Q8K299 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms