Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms