Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Nek9Q8K1R7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Nek9Q8K1R7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Nek9Q8K1R7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Nek9Q8K1R7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Nek9Q8K1R7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Nek9Q8K1R7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms