Protein–RNA interactions for Protein: Q8K168

1700001C19Rik, RIKEN cDNA 1700001C19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001C19RikQ8K168 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700001C19RikQ8K168 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700001C19RikQ8K168 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700001C19RikQ8K168 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700001C19RikQ8K168 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700001C19RikQ8K168 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700001C19RikQ8K168 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700001C19RikQ8K168 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700001C19RikQ8K168 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700001C19RikQ8K168 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700001C19RikQ8K168 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700001C19RikQ8K168 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700001C19RikQ8K168 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700001C19RikQ8K168 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700001C19RikQ8K168 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700001C19RikQ8K168 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
1700001C19RikQ8K168 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700001C19RikQ8K168 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
1700001C19RikQ8K168 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
1700001C19RikQ8K168 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700001C19RikQ8K168 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700001C19RikQ8K168 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700001C19RikQ8K168 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700001C19RikQ8K168 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700001C19RikQ8K168 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700001C19RikQ8K168 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700001C19RikQ8K168 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
1700001C19RikQ8K168 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms