Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0Y2

Krt33a, Keratin, type I cuticular Ha3-I, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33aQ8K0Y2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt33aQ8K0Y2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms