Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZX4

Rbm17, Splicing factor 45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm17Q8JZX4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbm17Q8JZX4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbm17Q8JZX4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbm17Q8JZX4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbm17Q8JZX4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbm17Q8JZX4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbm17Q8JZX4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbm17Q8JZX4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbm17Q8JZX4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbm17Q8JZX4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbm17Q8JZX4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbm17Q8JZX4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbm17Q8JZX4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbm17Q8JZX4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbm17Q8JZX4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbm17Q8JZX4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbm17Q8JZX4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbm17Q8JZX4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbm17Q8JZX4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbm17Q8JZX4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbm17Q8JZX4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbm17Q8JZX4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbm17Q8JZX4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbm17Q8JZX4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbm17Q8JZX4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbm17Q8JZX4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbm17Q8JZX4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbm17Q8JZX4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbm17Q8JZX4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbm17Q8JZX4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbm17Q8JZX4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbm17Q8JZX4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbm17Q8JZX4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rbm17Q8JZX4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rbm17Q8JZX4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Rbm17Q8JZX4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rbm17Q8JZX4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rbm17Q8JZX4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rbm17Q8JZX4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rbm17Q8JZX4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rbm17Q8JZX4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms