Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TwnkQ8CIW5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TwnkQ8CIW5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TwnkQ8CIW5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TwnkQ8CIW5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TwnkQ8CIW5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TwnkQ8CIW5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TwnkQ8CIW5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TwnkQ8CIW5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TwnkQ8CIW5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TwnkQ8CIW5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TwnkQ8CIW5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TwnkQ8CIW5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TwnkQ8CIW5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TwnkQ8CIW5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TwnkQ8CIW5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TwnkQ8CIW5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TwnkQ8CIW5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TwnkQ8CIW5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TwnkQ8CIW5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TwnkQ8CIW5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TwnkQ8CIW5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TwnkQ8CIW5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TwnkQ8CIW5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TwnkQ8CIW5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms