Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CopaQ8CIE6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CopaQ8CIE6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CopaQ8CIE6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CopaQ8CIE6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CopaQ8CIE6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CopaQ8CIE6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CopaQ8CIE6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CopaQ8CIE6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CopaQ8CIE6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CopaQ8CIE6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CopaQ8CIE6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CopaQ8CIE6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CopaQ8CIE6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CopaQ8CIE6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CopaQ8CIE6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CopaQ8CIE6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CopaQ8CIE6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CopaQ8CIE6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CopaQ8CIE6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CopaQ8CIE6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CopaQ8CIE6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CopaQ8CIE6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CopaQ8CIE6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CopaQ8CIE6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CopaQ8CIE6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CopaQ8CIE6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CopaQ8CIE6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CopaQ8CIE6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CopaQ8CIE6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CopaQ8CIE6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CopaQ8CIE6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CopaQ8CIE6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CopaQ8CIE6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CopaQ8CIE6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CopaQ8CIE6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms