Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms