Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ercc8Q8CFD5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ercc8Q8CFD5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ercc8Q8CFD5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ercc8Q8CFD5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ercc8Q8CFD5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ercc8Q8CFD5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ercc8Q8CFD5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ercc8Q8CFD5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ercc8Q8CFD5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ercc8Q8CFD5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ercc8Q8CFD5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ercc8Q8CFD5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ercc8Q8CFD5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ercc8Q8CFD5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ercc8Q8CFD5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ercc8Q8CFD5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ercc8Q8CFD5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ercc8Q8CFD5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ercc8Q8CFD5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ercc8Q8CFD5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ercc8Q8CFD5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ercc8Q8CFD5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ercc8Q8CFD5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ercc8Q8CFD5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ercc8Q8CFD5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ercc8Q8CFD5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ercc8Q8CFD5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ercc8Q8CFD5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ercc8Q8CFD5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ercc8Q8CFD5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ercc8Q8CFD5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ercc8Q8CFD5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ercc8Q8CFD5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ercc8Q8CFD5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ercc8Q8CFD5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ercc8Q8CFD5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ercc8Q8CFD5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ercc8Q8CFD5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ercc8Q8CFD5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ercc8Q8CFD5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ercc8Q8CFD5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ercc8Q8CFD5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ercc8Q8CFD5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ercc8Q8CFD5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ercc8Q8CFD5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ercc8Q8CFD5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ercc8Q8CFD5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ercc8Q8CFD5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ercc8Q8CFD5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ercc8Q8CFD5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ercc8Q8CFD5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ercc8Q8CFD5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ercc8Q8CFD5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ercc8Q8CFD5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ercc8Q8CFD5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ercc8Q8CFD5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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