Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Usp27Q8CEG8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp27Q8CEG8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp27Q8CEG8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp27Q8CEG8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp27Q8CEG8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms