Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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