Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ufl1Q8CCJ3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ufl1Q8CCJ3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ufl1Q8CCJ3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ufl1Q8CCJ3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ufl1Q8CCJ3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ufl1Q8CCJ3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ufl1Q8CCJ3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ufl1Q8CCJ3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ufl1Q8CCJ3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ufl1Q8CCJ3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ufl1Q8CCJ3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ufl1Q8CCJ3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ufl1Q8CCJ3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ufl1Q8CCJ3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ufl1Q8CCJ3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ufl1Q8CCJ3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ufl1Q8CCJ3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ufl1Q8CCJ3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ufl1Q8CCJ3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ufl1Q8CCJ3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ufl1Q8CCJ3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ufl1Q8CCJ3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ufl1Q8CCJ3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ufl1Q8CCJ3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ufl1Q8CCJ3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ufl1Q8CCJ3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ufl1Q8CCJ3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ufl1Q8CCJ3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ufl1Q8CCJ3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ufl1Q8CCJ3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms