Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RybpQ8CCI5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms