Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
E4f1Q8CCE9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms