Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBM3

Gm16223, MCG145574 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16223Q8CBM3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm16223Q8CBM3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm16223Q8CBM3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm16223Q8CBM3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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