Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms