Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dclre1bQ8C7W7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dclre1bQ8C7W7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dclre1bQ8C7W7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dclre1bQ8C7W7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dclre1bQ8C7W7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Dclre1bQ8C7W7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dclre1bQ8C7W7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dclre1bQ8C7W7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dclre1bQ8C7W7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dclre1bQ8C7W7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dclre1bQ8C7W7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dclre1bQ8C7W7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dclre1bQ8C7W7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dclre1bQ8C7W7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dclre1bQ8C7W7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dclre1bQ8C7W7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dclre1bQ8C7W7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dclre1bQ8C7W7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dclre1bQ8C7W7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dclre1bQ8C7W7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dclre1bQ8C7W7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dclre1bQ8C7W7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dclre1bQ8C7W7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dclre1bQ8C7W7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dclre1bQ8C7W7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dclre1bQ8C7W7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dclre1bQ8C7W7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dclre1bQ8C7W7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dclre1bQ8C7W7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dclre1bQ8C7W7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dclre1bQ8C7W7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dclre1bQ8C7W7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dclre1bQ8C7W7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dclre1bQ8C7W7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dclre1bQ8C7W7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Dclre1bQ8C7W7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dclre1bQ8C7W7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dclre1bQ8C7W7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dclre1bQ8C7W7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dclre1bQ8C7W7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Dclre1bQ8C7W7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dclre1bQ8C7W7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dclre1bQ8C7W7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dclre1bQ8C7W7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dclre1bQ8C7W7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms