Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhe22Q8C6A8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms