Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3B8

Rft1, Protein RFT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rft1Q8C3B8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rft1Q8C3B8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rft1Q8C3B8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rft1Q8C3B8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rft1Q8C3B8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms