Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Amigo3Q8C2S7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Amigo3Q8C2S7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Amigo3Q8C2S7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Amigo3Q8C2S7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Amigo3Q8C2S7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Amigo3Q8C2S7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Amigo3Q8C2S7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Amigo3Q8C2S7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Amigo3Q8C2S7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Amigo3Q8C2S7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Amigo3Q8C2S7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Amigo3Q8C2S7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Amigo3Q8C2S7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Amigo3Q8C2S7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Amigo3Q8C2S7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Amigo3Q8C2S7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Amigo3Q8C2S7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Amigo3Q8C2S7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Amigo3Q8C2S7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Amigo3Q8C2S7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Amigo3Q8C2S7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Amigo3Q8C2S7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Amigo3Q8C2S7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Amigo3Q8C2S7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Amigo3Q8C2S7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Amigo3Q8C2S7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Amigo3Q8C2S7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Amigo3Q8C2S7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Amigo3Q8C2S7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Amigo3Q8C2S7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Amigo3Q8C2S7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Amigo3Q8C2S7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Amigo3Q8C2S7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Amigo3Q8C2S7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
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