Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S0

Usp44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, mousemouse

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp44Q8C2S0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp44Q8C2S0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp44Q8C2S0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp44Q8C2S0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp44Q8C2S0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp44Q8C2S0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp44Q8C2S0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp44Q8C2S0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp44Q8C2S0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp44Q8C2S0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp44Q8C2S0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp44Q8C2S0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp44Q8C2S0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp44Q8C2S0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp44Q8C2S0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp44Q8C2S0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp44Q8C2S0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp44Q8C2S0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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Usp44Q8C2S0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp44Q8C2S0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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Usp44Q8C2S0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp44Q8C2S0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Usp44Q8C2S0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Usp44Q8C2S0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp44Q8C2S0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Usp44Q8C2S0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp44Q8C2S0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp44Q8C2S0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp44Q8C2S0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp44Q8C2S0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp44Q8C2S0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Usp44Q8C2S0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Usp44Q8C2S0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Usp44Q8C2S0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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Usp44Q8C2S0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp44Q8C2S0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp44Q8C2S0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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Usp44Q8C2S0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp44Q8C2S0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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Usp44Q8C2S0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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Usp44Q8C2S0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp44Q8C2S0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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Usp44Q8C2S0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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Usp44Q8C2S0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp44Q8C2S0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp44Q8C2S0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp44Q8C2S0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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Usp44Q8C2S0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp44Q8C2S0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp44Q8C2S0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp44Q8C2S0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp44Q8C2S0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp44Q8C2S0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp44Q8C2S0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp44Q8C2S0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp44Q8C2S0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp44Q8C2S0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp44Q8C2S0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp44Q8C2S0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp44Q8C2S0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp44Q8C2S0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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