Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg16l1Q8C0J2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms