Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK4

Rdh12, Retinol dehydrogenase 12, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh12Q8BYK4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdh12Q8BYK4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdh12Q8BYK4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdh12Q8BYK4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdh12Q8BYK4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdh12Q8BYK4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdh12Q8BYK4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdh12Q8BYK4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdh12Q8BYK4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh12Q8BYK4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh12Q8BYK4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh12Q8BYK4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh12Q8BYK4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh12Q8BYK4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh12Q8BYK4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh12Q8BYK4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh12Q8BYK4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh12Q8BYK4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh12Q8BYK4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh12Q8BYK4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh12Q8BYK4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh12Q8BYK4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh12Q8BYK4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh12Q8BYK4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh12Q8BYK4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh12Q8BYK4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rdh12Q8BYK4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rdh12Q8BYK4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rdh12Q8BYK4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rdh12Q8BYK4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rdh12Q8BYK4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rdh12Q8BYK4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rdh12Q8BYK4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rdh12Q8BYK4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms