Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp47Q8BY87 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Usp47Q8BY87 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp47Q8BY87 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp47Q8BY87 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp47Q8BY87 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp47Q8BY87 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp47Q8BY87 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp47Q8BY87 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp47Q8BY87 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp47Q8BY87 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp47Q8BY87 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp47Q8BY87 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp47Q8BY87 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp47Q8BY87 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp47Q8BY87 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp47Q8BY87 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp47Q8BY87 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp47Q8BY87 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp47Q8BY87 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp47Q8BY87 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp47Q8BY87 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp47Q8BY87 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
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