Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXN9

Tmem87a, Transmembrane protein 87A, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87aQ8BXN9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem87aQ8BXN9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tmem87aQ8BXN9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tmem87aQ8BXN9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tmem87aQ8BXN9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tmem87aQ8BXN9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms