Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slx1bQ8BX32 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms