Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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Ube3dQ8BX13 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ube3dQ8BX13 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms