Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kdm4aQ8BW72 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm4aQ8BW72 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms