Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snx17Q8BVL3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx17Q8BVL3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Snx17Q8BVL3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Snx17Q8BVL3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx17Q8BVL3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx17Q8BVL3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx17Q8BVL3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx17Q8BVL3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx17Q8BVL3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx17Q8BVL3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx17Q8BVL3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx17Q8BVL3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx17Q8BVL3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx17Q8BVL3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx17Q8BVL3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx17Q8BVL3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx17Q8BVL3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx17Q8BVL3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx17Q8BVL3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx17Q8BVL3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx17Q8BVL3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx17Q8BVL3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx17Q8BVL3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx17Q8BVL3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx17Q8BVL3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx17Q8BVL3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx17Q8BVL3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx17Q8BVL3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx17Q8BVL3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx17Q8BVL3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx17Q8BVL3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx17Q8BVL3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms