Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSZ2

Ap3s2, AP-3 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s2Q8BSZ2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3s2Q8BSZ2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3s2Q8BSZ2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3s2Q8BSZ2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3s2Q8BSZ2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3s2Q8BSZ2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3s2Q8BSZ2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3s2Q8BSZ2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3s2Q8BSZ2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3s2Q8BSZ2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3s2Q8BSZ2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3s2Q8BSZ2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3s2Q8BSZ2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3s2Q8BSZ2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3s2Q8BSZ2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3s2Q8BSZ2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3s2Q8BSZ2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3s2Q8BSZ2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3s2Q8BSZ2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3s2Q8BSZ2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3s2Q8BSZ2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3s2Q8BSZ2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3s2Q8BSZ2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3s2Q8BSZ2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3s2Q8BSZ2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms