Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSQ9

Pbrm1, Protein polybromo-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbrm1Q8BSQ9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pbrm1Q8BSQ9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pbrm1Q8BSQ9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Pbrm1Q8BSQ9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Pbrm1Q8BSQ9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pbrm1Q8BSQ9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pbrm1Q8BSQ9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pbrm1Q8BSQ9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pbrm1Q8BSQ9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pbrm1Q8BSQ9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pbrm1Q8BSQ9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pbrm1Q8BSQ9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pbrm1Q8BSQ9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pbrm1Q8BSQ9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pbrm1Q8BSQ9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pbrm1Q8BSQ9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pbrm1Q8BSQ9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pbrm1Q8BSQ9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pbrm1Q8BSQ9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pbrm1Q8BSQ9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pbrm1Q8BSQ9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pbrm1Q8BSQ9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pbrm1Q8BSQ9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pbrm1Q8BSQ9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pbrm1Q8BSQ9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pbrm1Q8BSQ9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pbrm1Q8BSQ9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pbrm1Q8BSQ9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pbrm1Q8BSQ9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pbrm1Q8BSQ9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pbrm1Q8BSQ9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pbrm1Q8BSQ9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pbrm1Q8BSQ9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pbrm1Q8BSQ9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pbrm1Q8BSQ9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pbrm1Q8BSQ9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pbrm1Q8BSQ9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Pbrm1Q8BSQ9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pbrm1Q8BSQ9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pbrm1Q8BSQ9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pbrm1Q8BSQ9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pbrm1Q8BSQ9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pbrm1Q8BSQ9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pbrm1Q8BSQ9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pbrm1Q8BSQ9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Pbrm1Q8BSQ9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pbrm1Q8BSQ9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pbrm1Q8BSQ9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pbrm1Q8BSQ9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pbrm1Q8BSQ9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pbrm1Q8BSQ9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pbrm1Q8BSQ9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pbrm1Q8BSQ9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pbrm1Q8BSQ9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pbrm1Q8BSQ9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pbrm1Q8BSQ9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pbrm1Q8BSQ9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pbrm1Q8BSQ9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pbrm1Q8BSQ9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pbrm1Q8BSQ9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pbrm1Q8BSQ9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pbrm1Q8BSQ9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pbrm1Q8BSQ9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Pbrm1Q8BSQ9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pbrm1Q8BSQ9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pbrm1Q8BSQ9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pbrm1Q8BSQ9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pbrm1Q8BSQ9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Pbrm1Q8BSQ9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Pbrm1Q8BSQ9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pbrm1Q8BSQ9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pbrm1Q8BSQ9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Pbrm1Q8BSQ9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pbrm1Q8BSQ9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Pbrm1Q8BSQ9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pbrm1Q8BSQ9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pbrm1Q8BSQ9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pbrm1Q8BSQ9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pbrm1Q8BSQ9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pbrm1Q8BSQ9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pbrm1Q8BSQ9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pbrm1Q8BSQ9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pbrm1Q8BSQ9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pbrm1Q8BSQ9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pbrm1Q8BSQ9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pbrm1Q8BSQ9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pbrm1Q8BSQ9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pbrm1Q8BSQ9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Pbrm1Q8BSQ9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pbrm1Q8BSQ9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Pbrm1Q8BSQ9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Pbrm1Q8BSQ9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pbrm1Q8BSQ9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pbrm1Q8BSQ9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pbrm1Q8BSQ9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pbrm1Q8BSQ9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pbrm1Q8BSQ9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pbrm1Q8BSQ9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pbrm1Q8BSQ9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms