Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hirip3Q8BLH7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms