Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLF2

Cdkl3, Cyclin-dependent kinase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl3Q8BLF2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkl3Q8BLF2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkl3Q8BLF2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkl3Q8BLF2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl3Q8BLF2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl3Q8BLF2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl3Q8BLF2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl3Q8BLF2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl3Q8BLF2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl3Q8BLF2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl3Q8BLF2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl3Q8BLF2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl3Q8BLF2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl3Q8BLF2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl3Q8BLF2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl3Q8BLF2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkl3Q8BLF2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkl3Q8BLF2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkl3Q8BLF2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkl3Q8BLF2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkl3Q8BLF2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkl3Q8BLF2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkl3Q8BLF2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkl3Q8BLF2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl3Q8BLF2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms