Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnrc6bQ8BKI2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms