Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKD6

Rnf144b, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144B, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144bQ8BKD6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf144bQ8BKD6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf144bQ8BKD6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf144bQ8BKD6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf144bQ8BKD6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf144bQ8BKD6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf144bQ8BKD6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Rnf144bQ8BKD6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf144bQ8BKD6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf144bQ8BKD6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf144bQ8BKD6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf144bQ8BKD6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf144bQ8BKD6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rnf144bQ8BKD6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rnf144bQ8BKD6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rnf144bQ8BKD6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf144bQ8BKD6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf144bQ8BKD6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf144bQ8BKD6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf144bQ8BKD6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf144bQ8BKD6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf144bQ8BKD6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf144bQ8BKD6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rnf144bQ8BKD6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf144bQ8BKD6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rnf144bQ8BKD6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rnf144bQ8BKD6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rnf144bQ8BKD6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Rnf144bQ8BKD6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf144bQ8BKD6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf144bQ8BKD6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf144bQ8BKD6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf144bQ8BKD6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf144bQ8BKD6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf144bQ8BKD6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Rnf144bQ8BKD6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf144bQ8BKD6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf144bQ8BKD6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf144bQ8BKD6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf144bQ8BKD6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Rnf144bQ8BKD6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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Rnf144bQ8BKD6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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