Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
D130040H23RikQ8BII3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
D130040H23RikQ8BII3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
D130040H23RikQ8BII3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
D130040H23RikQ8BII3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
D130040H23RikQ8BII3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
D130040H23RikQ8BII3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
D130040H23RikQ8BII3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
D130040H23RikQ8BII3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
D130040H23RikQ8BII3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
D130040H23RikQ8BII3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
D130040H23RikQ8BII3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
D130040H23RikQ8BII3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
D130040H23RikQ8BII3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
D130040H23RikQ8BII3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
D130040H23RikQ8BII3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
D130040H23RikQ8BII3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
D130040H23RikQ8BII3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
D130040H23RikQ8BII3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
D130040H23RikQ8BII3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
D130040H23RikQ8BII3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
D130040H23RikQ8BII3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
D130040H23RikQ8BII3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
D130040H23RikQ8BII3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
D130040H23RikQ8BII3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
D130040H23RikQ8BII3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
D130040H23RikQ8BII3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
D130040H23RikQ8BII3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
D130040H23RikQ8BII3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
D130040H23RikQ8BII3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
D130040H23RikQ8BII3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
D130040H23RikQ8BII3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
D130040H23RikQ8BII3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
D130040H23RikQ8BII3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
D130040H23RikQ8BII3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
D130040H23RikQ8BII3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
D130040H23RikQ8BII3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
D130040H23RikQ8BII3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
D130040H23RikQ8BII3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms