Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms